La Facoltà di Diritto Canonico San Pio X di Venezia intende raccogliere l'iniziativa del Patriarca Card. Giuseppe Sarto il quale, per concessione della Santa Sede, costituì, con lettera circolare del 19 ottobre 1902, un Istituto di Diritto Canonico presso il Seminario Patriarcale di Venezia, che aprì le sue porte nell'anno accademico 1902-1903. Tre anni dopo, il 16 novembre 1905, il Patriarca Sarto, eletto Sommo Pontefice con il nome di Pio X, con il Motu proprio Summo sane afficimur gaudio, erigeva la Facoltà con il potere di conferire i gradi accademici. Essa restò una creatura privilegiata che il Papa continuò a seguire nella ordinaria vita accademica fino alla sua morte nel 1914.

Con l'anno accademico 1931-1932 la Facoltà dovette sospendere la propria attività, non avendo potuto ottemperare per tempo ai requisiti richiesti dalla Costituzione Deus scientiarum Dominus del 14 maggio 1931 che regolamentava lo svolgimento della vita accademica di Università e Facoltà Ecclesiastiche.

Le attuali e complesse urgenze pastorali, nonché l'esistenza delle condizioni richieste dalla nuova normativa pontificia riguardante gli studi ecclesiastici, hanno consigliato di riprendere la tradizione inaugurata dal Patriarca Sarto, erigendo un nuovo Istituto di diritto canonico intitolato al Santo Pontefice.

Oggi la Facoltà San Pio X si inserisce nel più ampio progetto pedagogico accademico promosso dal Patriarcato di Venezia che va sotto il nome di Studium Generale Marcianum. Questa articolata realtà trova la sua origine nel desiderio di offrire una formazione globale alla persona, accompagnandola dalla Scuola Materna, Elementare, Media e Superiore (Fondazione Giovanni Paolo I) fino agli studi universitari (Studio Teologico e Istituto di Diritto Canonico San Pio X) e di specializzazione post-laurea (Studium Cattolico Veneziano), mettendo al centro i valori della fede cristiana in dialogo con la cultura contemporanea.

La Facoltà di Diritto Canonico San Pio X, eretta con decreto della Congregazione per l'Educazione Cattolica del 15 agosto 2008, conferisce i regolari gradi accademici in diritto canonico.
Oltre alle finalità comuni a tutte le Facoltà Ecclesiastiche, la Facoltà San Pio X intende promuovere e coltivare le discipline canonistiche mediante la ricerca scientifica, l'insegnamento e le pubblicazioni del proprio Corpo Docente. Particolare attenzione è data alla fondazione del Diritto in prospettiva teologica, al confronto con le altre Istituzioni accademiche e a quanto appartiene al patrimonio storico, spirituale e culturale della Regione Veneta.

La Facoltà di Diritto Canonico San Pio X ha dato inizio alle proprie attività accademiche nell'ottobre 2003, attivando contemporaneamente il primo anno del ciclo Propedeutico e il primo anno del ciclo di Licenza.